Les virus IAHP dérivent de virus IAFP qui ont évolué génétiquement et acquis des mutations modifiant la séquence peptidique du site de clivage protéolytique de la protéine d’enveloppe HA. Le clivage protéolytique de la HA permet la maturation du précurseur en deux sous-unités, libérant ainsi le peptide de fusion et rendant donc la protéine HA fonctionnelle. Chez les virus IAFP le site de clivage HA ne contient qu’un seul acide aminé basique (lysine ou arginine). Le site de clivage des virus IAFP est dit monobasique. Chez les virus IAHP le site de clivage HA contient plusieurs acides aminés basiques (lysine ou arginine). Le site de clivage des virus IAHP est dit polybasique. Si la HA n’est pas clivée, le peptide de fusion n’est pas exposé et l’enveloppe virale ne peut pas fusionner avec la membrane de la cellule hôte. Le clivage protéolytique de HA est donc nécessaire pour l’entrée du virus dans les cellules hôtes.